今回ハマッタのは、ftpの設定。
ダウンロードしてきて、解凍したファイルをftpでサーバーに送りこみ、パーミッションを700に変更してmt.cgiを実行しようとしたところ、Internal Server Errorになってしまうのだ。

答えは、ftpソフトの設定ミス。
ファイルの転送の際に、ファイル名やディレクトリ名全てを小文字に変換するチェックボックスにチェックが入っていた。
通常、写真ファイルなんかを転送するときに、大文字が混じると気持ち悪いのでこういう設定にしてftpを使用している。これがあだになった。
具体的には、/mt/lib/MT ←これが小文字になっていたため、ライブラリが読みこめず、このようなエラーになっていました。

皆さんも、ご注意あれ。